黎煥耀教授提出抗登革抗体因為有分子模擬構造上的關係,變成自体抗體,更進一步增加登革出血熱的嚴重性,此方面的研究報告,探討致病機制與疫苗研發安全的考量,對未來全世界登革疫苗的研發會有重大的影響。在二OO四年獲得財團法人王民寧先生紀念基金會「醫藥研究成果對國民健康有傑出貢獻獎」。獲獎使他更加確認要以研究傳染性疾病,拯救人命、改善人們生活為終生職志。